Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NEFLP07196 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEFLP07196 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEFLP07196 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEFLP07196 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEFLP07196 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEFLP07196 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEFLP07196 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NEFLP07196 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NEFLP07196 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEFLP07196 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEFLP07196 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEFLP07196 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEFLP07196 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEFLP07196 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEFLP07196 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEFLP07196 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEFLP07196 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEFLP07196 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFLP07196 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFLP07196 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFLP07196 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFLP07196 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFLP07196 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFLP07196 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFLP07196 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFLP07196 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFLP07196 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFLP07196 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFLP07196 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFLP07196 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFLP07196 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFLP07196 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFLP07196 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFLP07196 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFLP07196 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFLP07196 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFLP07196 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFLP07196 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFLP07196 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFLP07196 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFLP07196 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFLP07196 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFLP07196 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFLP07196 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFLP07196 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFLP07196 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFLP07196 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFLP07196 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFLP07196 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEFLP07196 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFLP07196 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFLP07196 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFLP07196 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFLP07196 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFLP07196 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFLP07196 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFLP07196 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFLP07196 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFLP07196 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFLP07196 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFLP07196 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFLP07196 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFLP07196 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFLP07196 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFLP07196 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFLP07196 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFLP07196 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFLP07196 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFLP07196 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFLP07196 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFLP07196 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFLP07196 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFLP07196 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFLP07196 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFLP07196 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFLP07196 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFLP07196 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEFLP07196 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFLP07196 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFLP07196 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFLP07196 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFLP07196 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFLP07196 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFLP07196 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFLP07196 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFLP07196 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFLP07196 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFLP07196 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFLP07196 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFLP07196 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFLP07196 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFLP07196 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFLP07196 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFLP07196 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFLP07196 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFLP07196 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFLP07196 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFLP07196 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEFLP07196 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms