Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX7O95931 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX7O95931 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms