Protein–RNA interactions for Protein: O43490

PROM1, Prominin-1, humanhuman

Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM1O43490 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PROM1O43490 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PROM1O43490 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PROM1O43490 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PROM1O43490 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PROM1O43490 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PROM1O43490 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PROM1O43490 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PROM1O43490 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PROM1O43490 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PROM1O43490 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PROM1O43490 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PROM1O43490 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PROM1O43490 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROM1O43490 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms