Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F3O00716 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F3O00716 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F3O00716 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F3O00716 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F3O00716 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F3O00716 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F3O00716 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F3O00716 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F3O00716 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F3O00716 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F3O00716 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F3O00716 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F3O00716 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F3O00716 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F3O00716 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F3O00716 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F3O00716 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F3O00716 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F3O00716 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F3O00716 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F3O00716 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F3O00716 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F3O00716 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F3O00716 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F3O00716 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F3O00716 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F3O00716 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F3O00716 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F3O00716 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F3O00716 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F3O00716 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F3O00716 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
E2F3O00716 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
E2F3O00716 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
E2F3O00716 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
E2F3O00716 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F3O00716 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms