Protein–RNA interactions for Protein: E9PIF3

NPIPA2, Nuclear pore complex-interacting protein family member A2, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA2E9PIF3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA2E9PIF3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms