Protein–RNA interactions for Protein: D6R9N7

USP17L18, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 18, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L18D6R9N7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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USP17L18D6R9N7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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USP17L18D6R9N7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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USP17L18D6R9N7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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USP17L18D6R9N7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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USP17L18D6R9N7 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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USP17L18D6R9N7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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USP17L18D6R9N7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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USP17L18D6R9N7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
USP17L18D6R9N7 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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