Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms