Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VGLL3A8MV65 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms