Protein–RNA interactions for Protein: A4D1B5

GSAP, Gamma-secretase-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSAPA4D1B5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSAPA4D1B5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms