Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms