Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAPRE3Q9UPY8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms