Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
STAG3Q9UJ98 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms