Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ9

REV1, DNA repair protein REV1, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV1Q9UBZ9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REV1Q9UBZ9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REV1Q9UBZ9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms