Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms