Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
THUMPD1Q9NXG2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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