Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms