Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SNTG1Q9NSN8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms