Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C11orf49Q9H6J7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms