Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms