Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms