Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCGF6Q9BYE7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms