Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTP6

ZBED2, Zinc finger BED domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED2Q9BTP6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZBED2Q9BTP6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZBED2Q9BTP6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms