Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms