Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms