Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CGREF1Q99674 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms