Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CSF3RQ99062 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSF3RQ99062 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSF3RQ99062 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSF3RQ99062 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSF3RQ99062 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CSF3RQ99062 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSF3RQ99062 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSF3RQ99062 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms