Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms