Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms