Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PGAM5Q96HS1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PGAM5Q96HS1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PGAM5Q96HS1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PGAM5Q96HS1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PGAM5Q96HS1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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