Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BICD1Q96G01 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms