Protein–RNA interactions for Protein: Q96DR5

BPIFA2, BPI fold-containing family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA2Q96DR5 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFA2Q96DR5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms