Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms