Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SELENOMQ8WWX9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENOMQ8WWX9 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENOMQ8WWX9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENOMQ8WWX9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms