Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms