Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYRIPQ8NFW9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms