Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF248Q8NDW4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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