Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GDPD1Q8N9F7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms