Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms