Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00269Q8N2A0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms