Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71Q8IV32 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms