Protein–RNA interactions for Protein: Q66K66

TMEM198, Transmembrane protein 198, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM198Q66K66 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms