Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLX4IPQ5VYV7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms