Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR44Q5JSH3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms