Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC38Q502W7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms