Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP28Q4G0W2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms