Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF212Q495C1 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms