Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY52

ZIK1, Zinc finger protein interacting with ribonucleoprotein K, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIK1Q3SY52 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms