Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP20-2Q3LI61 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms