Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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