Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms